La chapelle Saint-Jean a été construite au XIIe siècle, la première mention écrite remonte à 1350 sous le nom d'église Saint-Jean-Baptiste. Si la base de la tour-clocher date du XIIe siècle, l'ensemble restant épouse un style gothique tardif du XIVe siècle. Sa tour carrée à trois étages est percée au dernier étage d'ouïes géminées, elle surplombe le choeur de l'édifice qui est orienté selon la coutume vers l'Ouest. La chapelle Saint-Jean a souffert à la Révolution française, elle a été restaurée en 1938 et 1939 pour être utilisée par la paroisse protestante. La façade s'est écroulée en 1969 puis reconstruite à l'identique. La chapelle Saint-Jean se situe dans le centre-ville de Hoenheim à côté de l'hôtel de ville, elle représente une figure emblématique de la commune. L'intérieur de l'édifice renferme la pierre tombale du prêteur royal Jean-Baptiste Klinglin et de son épouse Marie-Anne Françoise Weinemer; datée de 1721, elle est inscrite à l'inventaire des Monuments Historiques depuis le 17 décembre 1998.